Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNT4Q9P109 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT4Q9P109 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms