Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCHIP1Q9P0W5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms