Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NDUFA13Q9P0J0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDUFA13Q9P0J0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms