Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARHGEF12Q9NZN5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
ARHGEF12Q9NZN5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms