Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYOFQ9NZM1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYOFQ9NZM1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYOFQ9NZM1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYOFQ9NZM1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYOFQ9NZM1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYOFQ9NZM1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYOFQ9NZM1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYOFQ9NZM1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MYOFQ9NZM1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYOFQ9NZM1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYOFQ9NZM1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms