Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VNN3Q9NY84 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms