Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPD3Q9NY59 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD3Q9NY59 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms