Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD4Q9NXE4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMPD4Q9NXE4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms