Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH5Q9NX47 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH5Q9NX47 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms