Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTLC3Q9NUV7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms