Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBRD1Q9NUN5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBRD1Q9NUN5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms