Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FOXD4L1Q9NU39 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD4L1Q9NU39 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD4L1Q9NU39 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms