Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTM9

CUTC, Copper homeostasis protein cutC homolog, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTCQ9NTM9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUTCQ9NTM9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUTCQ9NTM9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUTCQ9NTM9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUTCQ9NTM9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUTCQ9NTM9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CUTCQ9NTM9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CUTCQ9NTM9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CUTCQ9NTM9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUTCQ9NTM9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUTCQ9NTM9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUTCQ9NTM9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTCQ9NTM9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTCQ9NTM9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms