Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF275Q9NSD4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms