Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms