Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS45Q9NRW7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS45Q9NRW7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms