Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPHK2Q9NRA0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms