Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD93Q9NPY3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD93Q9NPY3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms