Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNB1IP1Q9NPC3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms