Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNPLA8Q9NP80 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms