Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRM3Q9NNZ6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRM3Q9NNZ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRM3Q9NNZ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms