Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD33

MRPL47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL47Q9HD33 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL47Q9HD33 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL47Q9HD33 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL47Q9HD33 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL47Q9HD33 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL47Q9HD33 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL47Q9HD33 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL47Q9HD33 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL47Q9HD33 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL47Q9HD33 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL47Q9HD33 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL47Q9HD33 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL47Q9HD33 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL47Q9HD33 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms