Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNA4Q9HCM2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PLXNA4Q9HCM2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms