Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCC2Q9HCC0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCC2Q9HCC0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms