Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRPV4Q9HBA0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPV4Q9HBA0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms