Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLSPNQ9HAW4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CLSPNQ9HAW4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLSPNQ9HAW4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms