Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LIN28AQ9H9Z2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms