Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2LQ9H987 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2LQ9H987 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2LQ9H987 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2LQ9H987 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2LQ9H987 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2LQ9H987 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms