Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NRDE2Q9H7Z3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NRDE2Q9H7Z3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms