Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNCQ9H7C4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms