Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAP3Q9H6T3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP3Q9H6T3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RPAP3Q9H6T3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms