Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPA3Q9H6K4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPA3Q9H6K4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPA3Q9H6K4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPA3Q9H6K4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPA3Q9H6K4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPA3Q9H6K4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
OPA3Q9H6K4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPA3Q9H6K4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPA3Q9H6K4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPA3Q9H6K4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPA3Q9H6K4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPA3Q9H6K4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPA3Q9H6K4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms