Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD1Q9H3U5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD1Q9H3U5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MFSD1Q9H3U5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms