Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX5Q9H2C1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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