Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG9Q9H0W8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG9Q9H0W8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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