Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB17Q9H0T7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB17Q9H0T7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms