Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.559e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 C14orf159-234ENST00000525393 2471 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.599e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 C14orf159-226ENST00000523461 2435 ntTSL 210.65□□□□□ -0.719e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 C14orf159-230ENST00000523837 2814 ntTSL 510.63□□□□□ -0.719e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.729e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.759e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.769e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.789e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.89e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.89e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.859e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 CPED1-209ENST00000520801 553 ntTSL 410.77□□□□□ -0.693e-10■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 CPED1-204ENST00000428526 2219 ntTSL 27.03□□□□□ -1.283e-10■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.486e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.266e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.396e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.175e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 WDR27-202ENST00000441385 683 ntTSL 311.87□□□□□ -0.515e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 WDR27-211ENST00000546525 3511 ntTSL 1 (best)11.23□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 C8orf82-205ENST00000534680 1637 ntTSL 521.71■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 C8orf82-203ENST00000527462 401 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.81□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 TSNARE1-202ENST00000518720 583 ntTSL 415.81■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 TSNARE1-206ENST00000520462 589 ntTSL 414.42□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 ATN1-202ENST00000396684 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.661e-9■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 PIAS4-202ENST00000593518 555 ntTSL 411.19□□□□□ -0.627e-7■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 PIAS4-204ENST00000599999 581 ntTSL 39.21□□□□□ -0.947e-7■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 PIAS4-205ENST00000600566 624 ntTSL 29.21□□□□□ -0.947e-7■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.64e-8■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-244ENST00000485673 715 ntTSL 526.02■■□□□ 1.762e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-243ENST00000484504 662 ntTSL 226.02■■□□□ 1.762e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-228ENST00000469431 702 ntTSL 524.72■■□□□ 1.552e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-257ENST00000604005 693 ntTSL 324.72■■□□□ 1.552e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-235ENST00000478585 543 ntTSL 224.72■■□□□ 1.552e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-229ENST00000470512 913 ntTSL 523.71■■□□□ 1.392e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-224ENST00000464960 986 ntTSL 223.68■■□□□ 1.382e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-237ENST00000480232 893 ntTSL 523.49■■□□□ 1.352e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.242e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.242e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.232e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-234ENST00000477931 1663 ntTSL 1 (best)21.78■■□□□ 1.082e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.862e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-248ENST00000488652 953 ntTSL 519.99■□□□□ 0.792e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-238ENST00000480975 1534 ntTSL 518.2■□□□□ 0.52e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-240ENST00000481768 1903 ntTSL 1 (best)17.84■□□□□ 0.452e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-226ENST00000467321 733 ntTSL 517.79■□□□□ 0.442e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-220ENST00000461152 278 ntTSL 517.31■□□□□ 0.362e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-230ENST00000472183 911 ntTSL 317.02■□□□□ 0.322e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-250ENST00000491348 1068 ntTSL 317.02■□□□□ 0.322e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-223ENST00000464788 583 ntTSL 214.75□□□□□ -0.052e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.062e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-249ENST00000490374 675 ntTSL 313.94□□□□□ -0.182e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-241ENST00000482112 704 ntTSL 313.59□□□□□ -0.232e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-221ENST00000462499 492 ntTSL 213.59□□□□□ -0.232e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.32e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-222ENST00000464624 3764 ntTSL 512.89□□□□□ -0.352e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-206ENST00000349036 581 ntTSL 512.49□□□□□ -0.412e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-219ENST00000453292 632 ntTSL 512.25□□□□□ -0.452e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.482e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-209ENST00000371081 730 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.642e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-252ENST00000493744 812 ntTSL 210.89□□□□□ -0.672e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-239ENST00000481039 756 ntTSL 510.78□□□□□ -0.682e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-217ENST00000423897 736 ntTSL 310.75□□□□□ -0.692e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-205ENST00000338783 641 ntTSL 310.75□□□□□ -0.692e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-247ENST00000488546 897 ntTSL 510.32□□□□□ -0.762e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-216ENST00000419558 729 ntTSL 310.22□□□□□ -0.772e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-208ENST00000371075 2551 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.842e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-204ENST00000313949 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.962e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-218ENST00000450130 595 ntTSL 58.9□□□□□ -0.982e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-227ENST00000468895 583 ntTSL 37.95□□□□□ -1.142e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-225ENST00000467227 543 ntTSL 37.88□□□□□ -1.152e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.652e-11■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.154e-7■■■■■ 27
CSTF2TQ9H0L4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.448e-9■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 CDC42EP1-203ENST00000430687 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.7■□□□□ 0.268e-9■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.084e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.744e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.694e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.694e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.674e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.564e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.474e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.434e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 SDHA-206ENST00000505555 2230 ntTSL 217.66■□□□□ 0.424e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.194e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.174e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 SDHA-218ENST00000515752 1809 ntTSL 513.78□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.394e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 CASP3-204ENST00000447121 549 ntTSL 312.61□□□□□ -0.394e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 AP001347.1-203ENST00000448463 780 ntTSL 212.19□□□□□ -0.464e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 SDHA-216ENST00000514027 2209 ntTSL 211.91□□□□□ -0.54e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 SDHA-219ENST00000515815 704 ntTSL 311.34□□□□□ -0.594e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 SDHA-209ENST00000509082 434 ntTSL 511.34□□□□□ -0.594e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 PTOV1-AS1-202ENST00000600742 3181 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.634e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 CASP3-206ENST00000523916 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.754e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 CASP3-201ENST00000308394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.874e-8■■■■■ 26.9
CSTF2TQ9H0L4 SDHA-214ENST00000511810 3001 ntTSL 29.03□□□□□ -0.964e-8■■■■■ 26.9
Retrieved 100 of 19,151 protein–RNA pairs in 194.2 ms