Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK2Q9H0K1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIK2Q9H0K1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK2Q9H0K1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms