Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXD1Q9GZZ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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