Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CFAP74Q9C0B2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CFAP74Q9C0B2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CFAP74Q9C0B2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms