Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXQ1Q9C009 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXQ1Q9C009 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
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