Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPRY4Q9C004 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRY4Q9C004 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms