Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BARHL1Q9BZE3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BARHL1Q9BZE3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARHL1Q9BZE3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms