Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPL3Q9BY60 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms