Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWL3

C1orf43, Uncharacterized protein C1orf43, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43Q9BWL3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf43Q9BWL3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf43Q9BWL3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms