Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM4Q9BWF3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM4Q9BWF3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM4Q9BWF3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM4Q9BWF3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBM4Q9BWF3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBM4Q9BWF3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBM4Q9BWF3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM4Q9BWF3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4Q9BWF3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms