Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM2Q9BVW6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms