Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM109Q9BVC6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM109Q9BVC6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms