Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RSRP1Q9BUV0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms