Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUD6

SPON2, Spondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPON2Q9BUD6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPON2Q9BUD6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPON2Q9BUD6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPON2Q9BUD6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPON2Q9BUD6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPON2Q9BUD6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPON2Q9BUD6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPON2Q9BUD6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPON2Q9BUD6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPON2Q9BUD6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms